De vuelta a Black Mesa, esta vez te introducirás en el papel de un Marine que deberá hacer callar a los científicos y a Gordon Freeman, personaje que interpretabas en la enterior entrega.
No todo a salido como esperabas y debes huir de allí lo antes posible. Tus compañeros te han abandonado, pero tendrás la compañía de un gran arsenal y esta completa guía.