Super Mario 64 ya cuenta con un modo multijugador cooperativo. Esta opción no ha sido implementada oficialmente por Nintendo, sino que ha sido obra de un programador aficionado, Skelux, que ha conseguido dotar de modo multijugador a este título 16 años después de su lanzamiento.

Super Mario 64 DS ya contaba con un modo multijugador, pero este se limitaba a ciertos niveles y no era cooperativo. Con el completo mod de Skelux, dos jugadores pueden cooperar mientras superan los distintos niveles del juego e interactuar entre ellos con nuevos movimientos como saltar uno sobre otro para alcanzar una altura mayor. El mod sólo es compatible con PC y puede descargarse aquí de manera gratuita.

Cabe recordar que este tipo de modificaciones van en contra de la legalidad, pues no están autorizadas por Nintendo.